More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3124 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 398 aa  792    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  79.24 
 
 		 398 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  77.97 
 
 		 398 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  78.64 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  76.88 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  76.13 
 
 		 417 aa  616  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  76.13 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  76.13 
 
 		 403 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  77.06 
 
 		 401 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  76.46 
 
 		 399 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  77.02 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  78.55 
 
 		 400 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  75.57 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  76.07 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  74.69 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  74.43 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  74.56 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  75.71 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  74 
 
 		 407 aa  594  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  74.49 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  73.12 
 
 		 403 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  72.89 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  72.89 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  72.89 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  70.9 
 
 		 401 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  71.36 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  73.06 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  70.85 
 
 		 402 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  72.84 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  73.1 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  68.98 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  70.48 
 
 		 411 aa  545  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  68.1 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  70.57 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  69.97 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  64.57 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  67.59 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  68.59 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 403 aa  521  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 403 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.38 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  62.31 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  65.09 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  65.06 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.3 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 395 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  64.57 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  66 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  65.15 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  63.18 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  63.18 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  61.96 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  62.72 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  63.18 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  61.77 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.9 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  60.76 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  60.76 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  63.89 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  57.97 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  62.63 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  57.97 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.58 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  57.21 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  57.8 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  60.55 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  58.39 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  57.52 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 383 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 383 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 383 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 383 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>