62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1387 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  78.36 
 
 
134 aa  213  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  76.87 
 
 
134 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  75.56 
 
 
135 aa  206  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  70.23 
 
 
136 aa  189  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  64.44 
 
 
139 aa  183  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  69.23 
 
 
133 aa  175  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  64.34 
 
 
136 aa  166  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  60 
 
 
136 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  60 
 
 
135 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  60 
 
 
135 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  55.22 
 
 
134 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  56.35 
 
 
133 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  57.97 
 
 
141 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  56.72 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  52.31 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  63.78 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  63.78 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  63.78 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  50.39 
 
 
141 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  48.84 
 
 
141 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  47.45 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  44.74 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  43.36 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  43.64 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  43.36 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  39.42 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  39.42 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  41.59 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  41.59 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  37.84 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  38.76 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  42.2 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  40.71 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  40.71 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  34.96 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  42.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  39.62 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  40.91 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  40.91 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  37.04 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  35.4 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  42.31 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  40.22 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  39.13 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  34.86 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  39.6 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  38.26 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  33.33 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  34.82 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  37.74 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  38.14 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  33.04 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  41.98 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  34.21 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  41.33 
 
 
107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  34.45 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  30.09 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  30.09 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  28.81 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  30.23 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  30.63 
 
 
143 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>