49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1290 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  54 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  53.49 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  37.84 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  30.1 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  36.67 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  30.39 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  38.55 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  25.74 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  38.27 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  32.94 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0720  cinnamoyl ester hydrolase  26.74 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  31.46 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0738  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 169 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  28.41 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  30.68 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  30.53 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>