30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3369 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  100 
 
 		 123 aa  249  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0324  general secretion pathway protein I, putative  63.39 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  53.64 
 
 		 111 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0590  hypothetical protein  49.07 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0603  general secretion pathway protein I  48.15 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1276  hypothetical protein  46.85 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0681  hypothetical protein  41.05 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0716  hypothetical protein  43.02 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0715  hypothetical protein  41.86 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  32.32 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  31.96 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1034  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2613  hypothetical protein  27.55 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76594  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  36.96 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  27.03 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  32 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  31.43 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  26.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  26.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  26.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  28.18 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  26.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  26.42 
 
 		 122 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>