More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3045 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3045  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165513  normal  0.962774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  84.09 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  85.91 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  77.93 
 
 		 509 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3674  magnesium chelatase ChlI subunit  77.48 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0127  hypothetical protein  66.52 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  65.16 
 
 		 510 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  61.54 
 
 		 508 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  60.09 
 
 		 511 aa  279  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  60.09 
 
 		 513 aa  279  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  63.47 
 
 		 513 aa  274  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  56.88 
 
 		 511 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0137  magnesium chelatase, ChlI subunit  77.5 
 
 		 185 aa  272  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  57.34 
 
 		 509 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  56.48 
 
 		 509 aa  268  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  56.88 
 
 		 512 aa  267  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  56.34 
 
 		 506 aa  266  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2773  competence protein ComM, putative  58.26 
 
 		 291 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  55.71 
 
 		 508 aa  264  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  59.82 
 
 		 512 aa  264  8.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  54.79 
 
 		 511 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  56.62 
 
 		 512 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  58.9 
 
 		 511 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  56.16 
 
 		 513 aa  261  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  54.34 
 
 		 508 aa  260  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  58.9 
 
 		 512 aa  259  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  55.25 
 
 		 512 aa  258  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  61.09 
 
 		 512 aa  258  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  51.58 
 
 		 501 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  54.79 
 
 		 513 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  51.13 
 
 		 501 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  56.76 
 
 		 506 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  55.25 
 
 		 513 aa  251  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0174  magnesium chelatase ChlI subunit  73.12 
 
 		 178 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.594218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  56.42 
 
 		 511 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  55.5 
 
 		 554 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  52.51 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  54.46 
 
 		 506 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  55.81 
 
 		 496 aa  248  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  52.51 
 
 		 514 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  54.46 
 
 		 507 aa  246  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  52.29 
 
 		 509 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  52.29 
 
 		 509 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  53.05 
 
 		 506 aa  244  6e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  57.21 
 
 		 505 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  50.92 
 
 		 509 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  52 
 
 		 516 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  50.23 
 
 		 510 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  53.42 
 
 		 514 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  51.36 
 
 		 510 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  56 
 
 		 485 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  52.31 
 
 		 509 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  51.14 
 
 		 498 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  54.55 
 
 		 516 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  57.01 
 
 		 504 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  54.13 
 
 		 512 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  53 
 
 		 512 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  55.4 
 
 		 505 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 		 509 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  54.26 
 
 		 495 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  52.07 
 
 		 511 aa  234  9e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0222  magnesium chelatase ChlI subunit  52.58 
 
 		 241 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00277196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0106  Mg(2+) chelatase family protein  54.09 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  53.33 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  52.34 
 
 		 504 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  52.21 
 
 		 518 aa  232  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  56.11 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  51.12 
 
 		 526 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  50.67 
 
 		 532 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  52.47 
 
 		 504 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  51.12 
 
 		 528 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  50.67 
 
 		 529 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  51.12 
 
 		 528 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  51.12 
 
 		 528 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  53.49 
 
 		 513 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2728  magnesium chelatase ChlI subunit  47.6 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  52.31 
 
 		 507 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.67 
 
 		 528 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.67 
 
 		 528 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.67 
 
 		 528 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.67 
 
 		 528 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  50.46 
 
 		 509 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  48.62 
 
 		 509 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  53.1 
 
 		 518 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50 
 
 		 501 aa  224  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  51.89 
 
 		 506 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0230  Mg chelatase, subunit ChlI  50.22 
 
 		 484 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  52.11 
 
 		 517 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50.23 
 
 		 520 aa  222  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 		 506 aa  221  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  52.09 
 
 		 510 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  51.17 
 
 		 515 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  51.92 
 
 		 505 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  48.88 
 
 		 510 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  50.46 
 
 		 512 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  51.17 
 
 		 523 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 		 507 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  50.7 
 
 		 510 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  48.88 
 
 		 510 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  50.22 
 
 		 518 aa  218  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>