26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2063 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  100 
 
 		 314 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  27.91 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 143 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 145 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 145 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 147 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 149 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 139 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 137 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  28.91 
 
 		 149 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  24.44 
 
 		 136 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  24.41 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  23.13 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  23.13 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  24.29 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  24.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 148 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 140 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>