58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1035 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  848    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  40.62 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  36.57 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  33.17 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  32.03 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  31.31 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  30.23 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  31.62 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  33.23 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  31.48 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  26.22 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  25.19 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  22.89 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  22.59 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  23.75 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1685  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  22.12 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.64 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.41 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  28.49 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.89 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.78 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.9 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  27.32 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.06 
 
 		 844 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 340 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  26.37 
 
 		 340 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.56 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  25.7 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  26.56 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  25.65 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3312  putative periplasmic solute-binding protein  26.8 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00706911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  46.51 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>