20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1685 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1685  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  22.12 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  22.83 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  20.83 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  21.43 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  21.2 
 
 		 409 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  23.56 
 
 		 435 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  21.08 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.27 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  26.22 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>