35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3115 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  100 
 
 		 319 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  63.21 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  61.27 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  60.06 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  55.52 
 
 		 327 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  55.52 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  55.21 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  56.78 
 
 		 327 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  60.06 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  56.35 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  53.94 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  52.85 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  56.66 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  56.66 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  55.73 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  56.66 
 
 		 323 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  55.21 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  54.57 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  54.57 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  56.01 
 
 		 323 aa  332  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  57.73 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  52.85 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  56.45 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  56.45 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  52.53 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.39 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  50.15 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.46 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  59.48 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  59.76 
 
 		 178 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  55.36 
 
 		 172 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.93 
 
 		 175 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  58.33 
 
 		 174 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.33 
 
 		 163 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  35.05 
 
 		 240 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>