30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2338 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  333  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  42.36 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  36.44 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  38.32 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  35.37 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  38.61 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  34.01 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  29.84 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  31.36 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 232 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  28.81 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  28.23 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  24.07 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 152 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 225 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>