34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1793 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1793    100 
 
 		 180 bp  357  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  89.47 
 
 		 915 bp  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 906 bp  54  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  82.76 
 
 		 657 bp  54  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    85.96 
 
 		 916 bp  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 915 bp  48.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  90 
 
 		 852 bp  48.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  89.74 
 
 		 906 bp  46.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  84.75 
 
 		 906 bp  46.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  91.43 
 
 		 558 bp  46.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  91.43 
 
 		 690 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  91.43 
 
 		 888 bp  46.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  88.37 
 
 		 912 bp  46.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    91.43 
 
 		 669 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    91.43 
 
 		 669 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  91.43 
 
 		 891 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>