More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1545 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5673  aldehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
476 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2908  Aldehyde Dehydrogenase  70.64 
 
 
487 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.491333  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5026  Betaine-aldehyde dehydrogenase  72.9 
 
 
487 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1545  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  978    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678495  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5602  aldehyde dehydrogenase  74.33 
 
 
487 aa  727    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4971  aldehyde dehydrogenase  66.94 
 
 
487 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0773  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.33 
 
 
518 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781579  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1492  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
492 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6594  aldehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
492 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.596939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3077  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
500 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364593  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2938  aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
490 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0055  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
498 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103268  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39 
 
 
506 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
490 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.45 
 
 
497 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.55 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.14 
 
 
498 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
502 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  38.37 
 
 
499 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
495 aa  333  5e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.24 
 
 
493 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.59 
 
 
496 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
490 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.8 
 
 
490 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.43 
 
 
493 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
493 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 
498 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  41.03 
 
 
493 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
495 aa  323  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
495 aa  322  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
493 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.47 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  40.66 
 
 
495 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  40.66 
 
 
495 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
495 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.91 
 
 
473 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  40.66 
 
 
495 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  38.69 
 
 
497 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  37.53 
 
 
501 aa  319  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  39.45 
 
 
524 aa  319  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
495 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
495 aa  319  7.999999999999999e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
499 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
498 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
499 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
496 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.08 
 
 
497 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
493 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  41.14 
 
 
499 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  36.6 
 
 
490 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  41.34 
 
 
496 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  40.08 
 
 
497 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
493 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.34 
 
 
496 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
489 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 
502 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.63 
 
 
497 aa  316  7e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.34 
 
 
528 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.82 
 
 
504 aa  316  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.74 
 
 
503 aa  316  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
498 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  40.69 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
495 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
498 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
498 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
483 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  38.49 
 
 
498 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
491 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
487 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
498 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 
483 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 
488 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
498 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
496 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.28 
 
 
498 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 
500 aa  310  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
497 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.79 
 
 
494 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
492 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.14 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.35 
 
 
501 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>