196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0796 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
381 aa  751    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  46.41 
 
 
382 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.81 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.7 
 
 
412 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  41.95 
 
 
322 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.06 
 
 
385 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  39.7 
 
 
373 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.24 
 
 
391 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.24 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.07 
 
 
391 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  30.35 
 
 
347 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  30.35 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  29.17 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  28.28 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  31.18 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  30.58 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  29.18 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  28.62 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  29.31 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  29.54 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  28.27 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  28.1 
 
 
363 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.25 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.45 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.11 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.26 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1866  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  20.97 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.53 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1168  putative acyl-coa dehydrogenase  23.93 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  21.55 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.56 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.96 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  21.92 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  21.92 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  22.22 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.2 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.3 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.78 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.22 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.69 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.1 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5014  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.88 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.7 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.41 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.78 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.75 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  22.07 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  28.25 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.77 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.19 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.92 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0156  Acyl-CoA dehydrogenase  23.72 
 
 
379 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2643  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.32 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.475979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2310  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.05 
 
 
384 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2352  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.05 
 
 
384 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.05 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  20.8 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  20.8 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.62 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  22.94 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.68 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  20.8 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  22.57 
 
 
381 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  22.57 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  20.8 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  20.8 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.64 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  22.57 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3157  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.13 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  22.57 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.36 
 
 
377 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.49 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.5 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.42 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.89 
 
 
388 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  22.39 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.62 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  22.94 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1789  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.36 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0858072  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  26.42 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.24 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  20.09 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  25.66 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.07 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.21 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.33 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  27.5 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.92 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.59 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.54 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.51 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0439927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2299  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.51 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0858  butyryl-CoA dehydrogenase  21.94 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.88 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.03 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.33 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3396  acyl-CoA dehydrogenase  20.24 
 
 
351 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581792  normal  0.0907936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>