33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2722 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  100 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  47.79 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  55.8 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  48.96 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  52.16 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  48.96 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  48.96 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  48.93 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  42.13 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  36.45 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  37.25 
 
 		 227 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  42.86 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  30.66 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  30.73 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  36.84 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  34.88 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  34.88 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  34.88 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  28.65 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  34.5 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  31.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  29.59 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  30.3 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  32.06 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  28.98 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  34.21 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  30.09 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  33 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.98 
 
 		 775 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5184  hypothetical protein  27.59 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0151548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  30.26 
 
 		 267 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  27.18 
 
 		 292 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>