19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1233 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  61.63 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  38.75 
 
 		 225 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  40.08 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  36.44 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  34.26 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  34.14 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  33.86 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  35.63 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  35.63 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  34.82 
 
 		 253 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  32.64 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  36.07 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  41.52 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  30.99 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  33.17 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  31.69 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  31.69 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  31.69 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>