22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3058 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  100 
 
 		 255 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  64.14 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  65.94 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  66.67 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  65.94 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  65.94 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  64.47 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  52.85 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  39.64 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  37.32 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  34.39 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  34.43 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  41.67 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  32.02 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  31.12 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  39.02 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  39.02 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  39.02 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  32.32 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  39.82 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  32.43 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>