28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1983 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  100 
 
 		 227 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  55.61 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  49.46 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  40.52 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  37.93 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  35.53 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  40.89 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  40.89 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  35.93 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  36.61 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  40.78 
 
 		 289 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  36.87 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  51.43 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  34.42 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  38.15 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  44.64 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  40.54 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  40.54 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  40.54 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  33.54 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  23.33 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  33.04 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  38.33 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  37.84 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  30.53 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  30 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  24.29 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2020  abortive infection protein  40.18 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>