31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2306 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  100 
 
 		 226 aa  411  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  50 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  45.75 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  42.93 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  39.29 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  39.57 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  38.73 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  40.1 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  46.26 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  38.5 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  39.29 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  39.29 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  42.22 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  44.73 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  35.09 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  39.78 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  36.36 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  43.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  43.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  43.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  37.08 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  21.03 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  36.17 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30.36 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  21.03 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  21.03 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  21.03 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  30.25 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  32 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  28.93 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  28.81 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>