28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2838 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  100 
 
 
244 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  100 
 
 
244 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  99.59 
 
 
244 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  78.15 
 
 
253 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  80.49 
 
 
256 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  80 
 
 
253 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  65.94 
 
 
255 aa  278  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  48.96 
 
 
250 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  39.64 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  41.2 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  41.24 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  35.89 
 
 
289 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  33.62 
 
 
247 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  43.06 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  36.11 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  33.88 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  43.8 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  43.8 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  43.8 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  31.29 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  35.14 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  22.39 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  20.9 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  21.39 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  21.39 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  21.39 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  35.24 
 
 
309 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>