20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0650 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  100 
 
 
246 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  61.14 
 
 
289 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  34.55 
 
 
247 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  36.33 
 
 
244 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  39.32 
 
 
225 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  35.83 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  36.33 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  36.33 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  39.82 
 
 
227 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  35.22 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  48.75 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  35 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  31.86 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  32.74 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  41.73 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  36.22 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  35 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  35 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  35 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  31.94 
 
 
223 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>