More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2629 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
515 aa  1009    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  51.64 
 
 
560 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  54.75 
 
 
573 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  54.75 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  54.75 
 
 
573 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  51.32 
 
 
551 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  49.79 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  51.33 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  50.82 
 
 
874 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  49.6 
 
 
568 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  50.21 
 
 
522 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  44.47 
 
 
536 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  46.17 
 
 
539 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  45.82 
 
 
517 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  48.16 
 
 
583 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  45.1 
 
 
540 aa  359  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  46.46 
 
 
593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  45.28 
 
 
543 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  43.23 
 
 
566 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  39.88 
 
 
551 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  44.44 
 
 
559 aa  332  9e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  45.4 
 
 
559 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  42.09 
 
 
518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  43.15 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  39.07 
 
 
606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  42.43 
 
 
883 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  42.63 
 
 
552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  40.04 
 
 
581 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  41.46 
 
 
527 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  42.86 
 
 
551 aa  293  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  42.33 
 
 
547 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  38.46 
 
 
533 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  40.21 
 
 
524 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  40.43 
 
 
508 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  40.92 
 
 
552 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  38.1 
 
 
518 aa  253  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  37.66 
 
 
546 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  37.37 
 
 
528 aa  211  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 
525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  39.24 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.18 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
510 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
521 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  28.85 
 
 
516 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  27.97 
 
 
526 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.34 
 
 
521 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  24.49 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 
506 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
516 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.13 
 
 
489 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
518 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
507 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  26.93 
 
 
518 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  26.91 
 
 
537 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.25 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.39 
 
 
507 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  26.14 
 
 
511 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
507 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  28.4 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
505 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
500 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.2 
 
 
553 aa  131  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  26.32 
 
 
514 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  26.93 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  28.23 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  26.73 
 
 
524 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  24.38 
 
 
512 aa  126  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.1 
 
 
477 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  29.36 
 
 
508 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
529 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
505 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  24.74 
 
 
512 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
529 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
529 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
529 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  26.68 
 
 
524 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 
512 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 
503 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 
529 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  25.55 
 
 
501 aa  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 
512 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 
512 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
515 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
520 aa  123  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  24.74 
 
 
512 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
534 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
504 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
509 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  24.74 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  26.32 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.32 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.32 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.52 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  28.78 
 
 
541 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>