More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2387 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 		 154 aa  321  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  79.72 
 
 		 155 aa  246  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  74.83 
 
 		 151 aa  244  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  78.32 
 
 		 153 aa  243  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  78.32 
 
 		 153 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  78.32 
 
 		 153 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  78.32 
 
 		 153 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  72.73 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  68.06 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  66.67 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  59.75 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  65.03 
 
 		 151 aa  201  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  61.81 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  63.4 
 
 		 167 aa  199  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  63.7 
 
 		 172 aa  199  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.69 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  65.22 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.59 
 
 		 151 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  58.33 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  63.12 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  63.09 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.31 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  63.51 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.96 
 
 		 163 aa  183  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60.56 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.43 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.45 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.38 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.65 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.56 
 
 		 178 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.41 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.8 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  45.88 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.66 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.17 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  46.75 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.36 
 
 		 233 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  40.67 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  43.66 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.26 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.45 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  39.16 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.44 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.44 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.28 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  40 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.45 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  41.3 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  35.25 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.43 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.43 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.71 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.99 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.99 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 		 163 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  35.57 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  37.32 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  39.04 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.37 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  36.36 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  36.62 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.32 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.32 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  36.62 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  35.46 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  39.71 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.43 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.62 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  33.09 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.3 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.3 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.3 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.41 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.3 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  39.31 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.75 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  37.86 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.99 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.51 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.51 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.21 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.77 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.09 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.14 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>