18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0182 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  57.21 
 
 
308 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  41.7 
 
 
348 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  42.86 
 
 
294 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  33.9 
 
 
282 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  39.11 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  33.99 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  38.54 
 
 
290 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  24.19 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  33.2 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  26.95 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  33.47 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  28.17 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  27.18 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  26.88 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  27.23 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11770  hypothetical protein  38.54 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.089091  normal  0.82834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>