More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3868 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  98.97 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  85.57 
 
 		 199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  81.31 
 
 		 211 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  78.5 
 
 		 215 aa  333  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  76.44 
 
 		 196 aa  320  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  75.25 
 
 		 201 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  52.33 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  51.81 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  47.87 
 
 		 193 aa  185  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  42.56 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  41.97 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  42.11 
 
 		 223 aa  150  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  40.54 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  42.63 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  38.74 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  38.58 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  36.65 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  36.96 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  38.38 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  37.06 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  41.15 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  39.49 
 
 		 234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  36.04 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  39.04 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  34.01 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  34.52 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  35.12 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  35.45 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  38.07 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  38.27 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1646  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2257  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  38.22 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  38.66 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  37.69 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  37.11 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2281  carbonate dehydratase  34.85 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.710265  normal  0.440808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  34.5 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  36.65 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  35.79 
 
 		 387 aa  131  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 267 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 267 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  37.17 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  37.82 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  37.43 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  35.75 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  36.65 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  37.43 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  37.17 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.23 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  35.94 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  37.04 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  38.34 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  38.34 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  34.38 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  35.2 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>