263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3384 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  100 
 
 		 94 aa  191  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  91.49 
 
 		 93 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  53.93 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  47.78 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  48.86 
 
 		 97 aa  87  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  53.93 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  45.45 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  46.07 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  46.07 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  49.44 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.28 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  56.34 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  47.62 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  46.43 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  49.44 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  47.73 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  54.93 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  47.19 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  46.59 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  47.13 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  40.91 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  47.19 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.56 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  49.44 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  49.44 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  41.86 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  49.4 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  51.39 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  52.94 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  50.57 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  45.45 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  47.13 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  45.12 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  40.7 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  45.45 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  53.66 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  44.05 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  44.19 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  44.19 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  47.56 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  39.33 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  50 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  45.98 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  39.08 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  45.45 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.18 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  41.76 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  46.75 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  47.67 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  47.89 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  43.53 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  43.33 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  43.37 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.5 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  44.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  43.37 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  43.37 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  43.37 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  44.32 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  43.37 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  40.91 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  43.37 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  48.81 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  40.66 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.56 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  44.58 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  42.17 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  45.24 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  46.25 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  42.17 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  43.9 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  41.38 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  45.65 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  40 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  45.68 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.28 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  48.19 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  36.36 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  40.51 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  40.7 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  51.61 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  35.29 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  41.98 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  37.21 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  41.46 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  40.85 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.5 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  34.12 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  42.68 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>