17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2781 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.54 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  43.81 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  44.13 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  43.81 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  45.76 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  30.41 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  26.81 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  31.07 
 
 		 671 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.1 
 
 		 657 aa  49.3  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  35.29 
 
 		 435 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  29.73 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  38.89 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.08 
 
 		 666 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.62 
 
 		 672 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  30.5 
 
 		 715 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>