More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1606 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1606  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 324 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.7 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  36.01 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.45 
 
 		 312 aa  225  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.37 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  35.29 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  35.29 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  33.54 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  36.13 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  38.8 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  34.54 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 		 387 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  36.66 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  38.21 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 347 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  36.09 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  35.55 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  36.58 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  36.33 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  36.33 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  34.88 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  35.79 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  34.11 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0299  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  35.23 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  38.13 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  35.67 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  34.45 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  36.42 
 
 		 373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 		 373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  33.55 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  33.99 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  35.6 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  35.95 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.64 
 
 		 319 aa  199  7.999999999999999e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  35.1 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.97 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.97 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.97 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  36.45 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  34.2 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  34.2 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.22 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  36.12 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  33.88 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  36.54 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>