36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3271 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  33.68 
 
 
203 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  36.13 
 
 
197 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  34.2 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  32.84 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  32.34 
 
 
199 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  32 
 
 
205 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  34.92 
 
 
200 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  32.42 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  34.01 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  30.69 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  31.72 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  31.75 
 
 
207 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  30.85 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  29.41 
 
 
204 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  29.05 
 
 
205 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  25.68 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  30.27 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  27.41 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  27.53 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  27.55 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  26.29 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  25.71 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  25.52 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  25.42 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  21.54 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  27.71 
 
 
89 aa  55.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  24.02 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  25.81 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  24.76 
 
 
283 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>