174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1752 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  100 
 
 
329 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  77.81 
 
 
329 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  77.81 
 
 
329 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  77.2 
 
 
329 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  77.2 
 
 
329 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  57.01 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  57.01 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  57.62 
 
 
328 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  51.37 
 
 
326 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  49.7 
 
 
329 aa  323  3e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  51.41 
 
 
329 aa  322  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  47.66 
 
 
331 aa  315  7e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  46.39 
 
 
329 aa  311  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  48.91 
 
 
329 aa  309  5e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  47.04 
 
 
331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  46.08 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  47.69 
 
 
337 aa  305  6e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  45.91 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  42.25 
 
 
325 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  43.47 
 
 
326 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.34 
 
 
345 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.9 
 
 
327 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.49 
 
 
340 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.49 
 
 
340 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  41.34 
 
 
339 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  39.81 
 
 
333 aa  258  8e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  39.81 
 
 
336 aa  255  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  38.41 
 
 
334 aa  250  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  39.48 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  35.8 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  36.25 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  36.42 
 
 
334 aa  209  4e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  38.1 
 
 
343 aa  208  9e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.36 
 
 
332 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  36.67 
 
 
332 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.29 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.65 
 
 
339 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  33.99 
 
 
338 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  33.99 
 
 
338 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  33.99 
 
 
338 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  33.44 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  32.81 
 
 
338 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  32.81 
 
 
338 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  33.77 
 
 
338 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  32.33 
 
 
338 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  33.55 
 
 
337 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  33.88 
 
 
338 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  33.44 
 
 
338 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  32.93 
 
 
338 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.93 
 
 
338 aa  185  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  32.63 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  32.63 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  32.63 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  32.63 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  32.63 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  32.5 
 
 
338 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  32.93 
 
 
562 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  32.03 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  31.79 
 
 
337 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  29.61 
 
 
338 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
396 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  37.66 
 
 
245 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  36.68 
 
 
437 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  31.92 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  31.83 
 
 
475 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.93 
 
 
530 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.3 
 
 
363 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  30.36 
 
 
247 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.06 
 
 
372 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.51 
 
 
360 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.74 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  27.82 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.05 
 
 
356 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  29.05 
 
 
356 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.32 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.83 
 
 
365 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.59 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.53 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.01 
 
 
278 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  25.62 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.74 
 
 
276 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  29.51 
 
 
257 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.49 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.72 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.72 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.07 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>