212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1407 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  44.49 
 
 
701 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 
709 aa  1452    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  81.5 
 
 
714 aa  1178    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  43.2 
 
 
701 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  41.08 
 
 
612 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  29.49 
 
 
705 aa  321  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  28.76 
 
 
741 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  30.4 
 
 
668 aa  244  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  27.64 
 
 
681 aa  223  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  26.17 
 
 
639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  26.25 
 
 
698 aa  218  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  26.25 
 
 
698 aa  218  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  24.1 
 
 
688 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.9 
 
 
696 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.16 
 
 
703 aa  191  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  25.61 
 
 
687 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.96 
 
 
705 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  23.25 
 
 
651 aa  183  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  23.25 
 
 
651 aa  183  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.12 
 
 
692 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.34 
 
 
712 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.78 
 
 
696 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  24.05 
 
 
698 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  23.64 
 
 
689 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.94 
 
 
683 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  23.55 
 
 
685 aa  163  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  23.81 
 
 
652 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  25.56 
 
 
648 aa  157  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.91 
 
 
670 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  22.65 
 
 
678 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  29.32 
 
 
642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  23.88 
 
 
710 aa  142  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  26.65 
 
 
656 aa  134  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  23.89 
 
 
655 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  24.4 
 
 
684 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  27.2 
 
 
680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.51 
 
 
661 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  24.07 
 
 
637 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  24.07 
 
 
637 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  24.07 
 
 
637 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  23.66 
 
 
710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  23.66 
 
 
710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  24.07 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  24.07 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.17 
 
 
143 aa  122  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  41.1 
 
 
151 aa  121  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  24.94 
 
 
663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  25.94 
 
 
638 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  23.57 
 
 
517 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.66 
 
 
636 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  21.58 
 
 
516 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  23.57 
 
 
674 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  22.67 
 
 
516 aa  112  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.8 
 
 
641 aa  111  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0380  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.06 
 
 
147 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0390  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  37.06 
 
 
147 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  29.17 
 
 
559 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  23.59 
 
 
636 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2983  hypothetical protein  52.08 
 
 
102 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000183001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  26.52 
 
 
643 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.76 
 
 
646 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0644  putative PTS system, ascorbate-specific IIA component SgaA  39.02 
 
 
144 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  24.76 
 
 
646 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.05 
 
 
646 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.41 
 
 
151 aa  105  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  24.33 
 
 
646 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.55 
 
 
149 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0342  phosphotransferase enzyme II, A component  30.07 
 
 
147 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  24.52 
 
 
646 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  24.52 
 
 
646 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1440  mannitol-specific cryptic phosphotransferase enzyme IIA component  30.07 
 
 
147 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000613996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  24.52 
 
 
646 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.07 
 
 
147 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  24.48 
 
 
646 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  25.49 
 
 
646 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.55 
 
 
625 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2057  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
147 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.761537  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.71 
 
 
147 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.92 
 
 
138 aa  99.4  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0778  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.65 
 
 
153 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.03 
 
 
147 aa  98.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  23.37 
 
 
685 aa  97.8  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2750  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.96 
 
 
143 aa  95.1  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  22.14 
 
 
557 aa  94.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3798  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.11 
 
 
154 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  29.46 
 
 
470 aa  94  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5711  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  31.11 
 
 
154 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1408  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.64 
 
 
147 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.808256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2846  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.23 
 
 
147 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000475828  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.04 
 
 
628 aa  92.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4666  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  31.3 
 
 
154 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3818  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.06 
 
 
154 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4803  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.64 
 
 
154 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.31 
 
 
144 aa  90.5  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4663  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.64 
 
 
154 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.9682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4653  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.64 
 
 
154 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4746  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.64 
 
 
154 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4782  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.64 
 
 
154 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.34657  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  21.67 
 
 
496 aa  89  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04062  L-ascorbate-specific enzyme IIA component of PTS  30.53 
 
 
154 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>