More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3299 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3299  carboxyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 536 aa  1101    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.96484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0496  Propionyl-CoA carboxylase  87.69 
 
 		 574 aa  993    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4093  propionyl-CoA carboxylase  89.93 
 
 		 574 aa  1011    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0651  propionyl-CoA carboxylase  86.19 
 
 		 574 aa  969    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3248  carboxyl transferase  95.34 
 
 		 574 aa  1061    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000151577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0463  propionyl-CoA carboxylase  87.5 
 
 		 574 aa  992    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3262  Propionyl-CoA carboxylase  86.38 
 
 		 574 aa  971    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0491  Propionyl-CoA carboxylase  87.5 
 
 		 574 aa  993    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.669185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0562  carboxyl transferase  85.07 
 
 		 574 aa  959    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3488  propionyl-CoA carboxylase  83.77 
 
 		 574 aa  953    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0575  Propionyl-CoA carboxylase  85.26 
 
 		 574 aa  959    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  36.19 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  35.71 
 
 		 514 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.33 
 
 		 521 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  41.03 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  34.42 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  37.5 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  39.58 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  33.72 
 
 		 511 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  35.02 
 
 		 514 aa  293  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  39.44 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  38.14 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  38.14 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  34.41 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  34.97 
 
 		 516 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  39.86 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  38.08 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  33.27 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  38.05 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  34.41 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  34.82 
 
 		 513 aa  287  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  38.98 
 
 		 508 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  32.65 
 
 		 509 aa  286  7e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  34.36 
 
 		 510 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.14 
 
 		 516 aa  286  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  34.17 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  34.56 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  34.56 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  35.53 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  34.4 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  33.79 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  33.96 
 
 		 549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  34.37 
 
 		 510 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  34.17 
 
 		 510 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  37.58 
 
 		 519 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  33.21 
 
 		 510 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  37.85 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  34.47 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  33.78 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  33.46 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.21 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  34.76 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  38.52 
 
 		 516 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  33.72 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  33.58 
 
 		 514 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  33.91 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 519 aa  280  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  34.76 
 
 		 510 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  34.1 
 
 		 513 aa  279  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  35.84 
 
 		 513 aa  279  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  34.15 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  34.42 
 
 		 510 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  39.04 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.74 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  33.02 
 
 		 531 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  33.97 
 
 		 531 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  35.92 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.42 
 
 		 514 aa  277  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  34.16 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  33.98 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 516 aa  276  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 523 aa  276  8e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  34.55 
 
 		 549 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  37.25 
 
 		 522 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 517 aa  276  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  35.15 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  38.1 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  33.99 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  32.14 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  36.51 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  34.26 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  34.81 
 
 		 530 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  34.46 
 
 		 564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  33.58 
 
 		 514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  37.5 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 538 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  37 
 
 		 528 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  32.63 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  33.92 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  34.23 
 
 		 510 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  34.54 
 
 		 512 aa  272  9e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>