More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3056 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  78.85 
 
 
694 aa  1141    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
696 aa  1397    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  49.62 
 
 
696 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.06 
 
 
693 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  75.83 
 
 
692 aa  1094    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.28 
 
 
695 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  75.83 
 
 
692 aa  1094    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.7 
 
 
676 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.83 
 
 
694 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
693 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.31 
 
 
700 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.37 
 
 
703 aa  678    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.8 
 
 
694 aa  779    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  89.94 
 
 
694 aa  1228    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.43 
 
 
703 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
697 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.32 
 
 
698 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
689 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.53 
 
 
703 aa  644    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.26 
 
 
695 aa  769    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.05 
 
 
686 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  75.61 
 
 
696 aa  1047    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.03 
 
 
690 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.08 
 
 
700 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.85 
 
 
699 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.03 
 
 
695 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.91 
 
 
692 aa  651    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.08 
 
 
700 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.65 
 
 
706 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.56 
 
 
708 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
686 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.11 
 
 
697 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.47 
 
 
708 aa  719    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  77.01 
 
 
695 aa  1117    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.56 
 
 
708 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.6 
 
 
699 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.65 
 
 
703 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.25 
 
 
690 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
700 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.8 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.26 
 
 
692 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.07 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.07 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.07 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.27 
 
 
698 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.83 
 
 
692 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.07 
 
 
699 aa  631  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.1 
 
 
700 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.55 
 
 
695 aa  632  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.1 
 
 
700 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.3 
 
 
700 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.1 
 
 
692 aa  628  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.52 
 
 
699 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.28 
 
 
699 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.9 
 
 
697 aa  622  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  48 
 
 
674 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.96 
 
 
697 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 
700 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.12 
 
 
699 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.78 
 
 
710 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.25 
 
 
705 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.5 
 
 
697 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.44 
 
 
697 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.98 
 
 
694 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.53 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.81 
 
 
699 aa  614  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.43 
 
 
690 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.81 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.81 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.67 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.2 
 
 
694 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  48.95 
 
 
692 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01839  hypothetical protein  48.95 
 
 
692 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2111  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.95 
 
 
692 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.13 
 
 
699 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.13 
 
 
699 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.13 
 
 
699 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.15 
 
 
711 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.7 
 
 
692 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.66 
 
 
679 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1308  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.95 
 
 
692 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.201196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1974  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.02 
 
 
692 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.98 
 
 
699 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.95 
 
 
692 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.37 
 
 
699 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.21 
 
 
690 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.93 
 
 
699 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.44 
 
 
692 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.62 
 
 
688 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.42 
 
 
693 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2068  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.24 
 
 
692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1209  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.71 
 
 
692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886625  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.54 
 
 
699 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>