20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1978 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  29.06 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  29.88 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.93 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  29.03 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  28.75 
 
 		 516 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  27.23 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  25.82 
 
 		 533 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  24.37 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  26.67 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  26.82 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  24.32 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  22.78 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.03 
 
 		 520 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.42 
 
 		 505 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  22.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1018  hypothetical protein  23.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3450  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.208016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  26.49 
 
 		 528 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>