29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1127 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  84.68 
 
 		 125 aa  213  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  76 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  68 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  66.94 
 
 		 128 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  66.67 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  58.06 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  70.11 
 
 		 223 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  29.91 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  27.88 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  30.77 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  27.88 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  32.56 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  30 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  28.3 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  28.3 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  28.43 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  28.43 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  24.04 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  28.43 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  27.45 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  27.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  27.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  27.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  27.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  27.27 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>