More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0818 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  60.75 
 
 		 546 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 		 539 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 541 aa  1100    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  61.78 
 
 		 539 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  60.37 
 
 		 539 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  61.77 
 
 		 534 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  58.23 
 
 		 541 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  71.72 
 
 		 541 aa  807    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.26 
 
 		 541 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  59.15 
 
 		 541 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 539 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  64.35 
 
 		 540 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  61.78 
 
 		 539 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  58.78 
 
 		 541 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  58.6 
 
 		 541 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  59.29 
 
 		 542 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  60.75 
 
 		 539 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  77.08 
 
 		 541 aa  875    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  58.91 
 
 		 540 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 542 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  59.66 
 
 		 542 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.44 
 
 		 541 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  60.85 
 
 		 545 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  61 
 
 		 541 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  60.41 
 
 		 569 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 542 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  61 
 
 		 541 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  59.66 
 
 		 542 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  58.27 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  54.61 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 536 aa  623  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  55.45 
 
 		 524 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  56.76 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  60.04 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  61.58 
 
 		 459 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  41.55 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.33 
 
 		 477 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 		 479 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  30.12 
 
 		 479 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  30.12 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.21 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.12 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.77 
 
 		 466 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.11 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.23 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.23 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.22 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  30.4 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.33 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.9 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  28.69 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 		 477 aa  200  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  28.71 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  29.2 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  28.35 
 
 		 476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  29.68 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.7 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29.22 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  29 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.08 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  27.63 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.19 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.08 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.08 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.85 
 
 		 477 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  28.66 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  28.66 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  27.36 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  25.78 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.66 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.89 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.66 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  28.22 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  29.05 
 
 		 479 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.48 
 
 		 484 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  31.16 
 
 		 494 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  28.25 
 
 		 479 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  29.05 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.87 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  29.05 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  26.6 
 
 		 478 aa  157  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0367  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.71 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  26.13 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.41 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  29.09 
 
 		 489 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  28.83 
 
 		 479 aa  156  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.25 
 
 		 507 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  28.04 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  28.83 
 
 		 479 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>