54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3940 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4351  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.43 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4374  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.08 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4218  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.575493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.23 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  28.12 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.4 
 
 
181 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.75 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.82 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7049  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.62 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.09 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.31 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1798  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.24 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000117501  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.64 
 
 
442 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.33 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.16 
 
 
189 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.01 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.46 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.68 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4368  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.43 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0452555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.79 
 
 
169 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.33 
 
 
174 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.46 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.82 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  23.92 
 
 
174 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.73 
 
 
230 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  25 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  27.78 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1779  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.98 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  23.11 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  26.9 
 
 
175 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.83 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  34.67 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07660  phospholipid metabolism-related protein, putative  24.84 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.19 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.67 
 
 
182 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.25 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.54 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.17 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.67 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.85 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.85 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.5 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2099  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.05 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.85 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4096  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.93 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40261  predicted protein  26.8 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.73 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.31 
 
 
272 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02240  phospholipid metabolism-related protein, putative  35 
 
 
396 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0798005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.65 
 
 
279 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>