142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1780 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 
369 aa  745    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  94.31 
 
 
369 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  57.85 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  60.06 
 
 
376 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  58.23 
 
 
321 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  53.6 
 
 
378 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  49.73 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.22 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  34.63 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  34.29 
 
 
625 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  33.96 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  34.23 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  33.61 
 
 
386 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  36.58 
 
 
363 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  32.79 
 
 
381 aa  170  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  32.26 
 
 
526 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  33.64 
 
 
437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  32.1 
 
 
382 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  29.38 
 
 
391 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  29.85 
 
 
720 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  31.98 
 
 
384 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  30.53 
 
 
391 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  30.93 
 
 
432 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  27.76 
 
 
407 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  30.26 
 
 
391 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  36.07 
 
 
314 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.25 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  29.23 
 
 
397 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  35 
 
 
450 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  32.06 
 
 
463 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  31.13 
 
 
368 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.71 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.62 
 
 
320 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  32.86 
 
 
345 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.37 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  32.19 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  32.89 
 
 
339 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.98 
 
 
388 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  32.55 
 
 
339 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.36 
 
 
259 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  32.55 
 
 
339 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  32.55 
 
 
339 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  27.15 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  32.21 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  32.21 
 
 
339 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.1 
 
 
322 aa  136  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.48 
 
 
570 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  31.88 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  32.19 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  34.04 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  29.91 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  33.59 
 
 
291 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  33.59 
 
 
291 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  33.59 
 
 
291 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  31.54 
 
 
339 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  32.75 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  32.4 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  27.47 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  29.43 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.4 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  30.99 
 
 
317 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.12 
 
 
563 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  30.15 
 
 
316 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  32.06 
 
 
316 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  28.92 
 
 
471 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  28.03 
 
 
405 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  29.53 
 
 
405 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.55 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  33.92 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  32.38 
 
 
326 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.02 
 
 
321 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  27.63 
 
 
708 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.43 
 
 
675 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  31.16 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  31.18 
 
 
568 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  29.24 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  29.58 
 
 
495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  30.07 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.6 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  32.81 
 
 
472 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  32 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  28.36 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  27.8 
 
 
340 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  26.58 
 
 
443 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.59 
 
 
686 aa  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  28 
 
 
326 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  33.48 
 
 
489 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.14 
 
 
317 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0071  SpoIID/LytB domain protein  27.48 
 
 
336 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000124334  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  42.03 
 
 
852 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  29.79 
 
 
833 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  28.81 
 
 
584 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  32.2 
 
 
555 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  29.9 
 
 
558 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  40.34 
 
 
361 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.61 
 
 
503 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  30.27 
 
 
459 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2653  sporulation protein, amidase enhancer  29.19 
 
 
612 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  25.07 
 
 
517 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>