16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1016 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 396 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2313  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  27.45 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4868  hypothetical protein  25.34 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3297  hypothetical protein  25.34 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 218 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4944  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 620 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0846  hypothetical protein  26.2 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>