13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2864 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4944  hypothetical protein  35.8 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2313  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5862  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 374 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 389 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 581 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2082  hypothetical protein  30.52 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00946987  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24770  predicted transcriptional regulator with HTH domain protein  29.91 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>