More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6912 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6912  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6891  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.33 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2934  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1370  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  28.12 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 		 333 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 258 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 258 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 258 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.95 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  28.14 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.35 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.06 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  30.69 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.61 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  30.91 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  31 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  31.63 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.35 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  31 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.69 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.53 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.5 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  30.5 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.5 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  29.36 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.5 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  27.71 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.96 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  30.2 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  29 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  29 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  29 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  29 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  28.19 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  29.5 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  27.1 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.78 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  27.48 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  29.7 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  27.1 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  28.38 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  26.2 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  29.33 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  29.61 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  27.02 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  27.02 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>