16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4900 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  100 
 
 
714 aa  1346    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  66.67 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.64 
 
 
2914 aa  64.3  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.96 
 
 
2449 aa  63.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  36.02 
 
 
407 aa  62  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  37.09 
 
 
520 aa  61.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  41.32 
 
 
388 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  31.33 
 
 
419 aa  54.7  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  32.29 
 
 
389 aa  50.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.08 
 
 
2397 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  33.59 
 
 
412 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  34.39 
 
 
636 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  35.29 
 
 
415 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  33.33 
 
 
634 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  31.34 
 
 
354 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.91 
 
 
413 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>