137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4717 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  100 
 
 
116 aa  234  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  80.2 
 
 
119 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  53 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.23 
 
 
618 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  35.64 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.65 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  34.02 
 
 
205 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  40.85 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  40.98 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  40.98 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.67 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.26 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
547 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  27.78 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.5 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  36.25 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  39.34 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.27 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.05 
 
 
111 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  36.05 
 
 
111 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.05 
 
 
111 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.05 
 
 
111 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  36.05 
 
 
111 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.05 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  30.3 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.05 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  35.05 
 
 
101 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.82 
 
 
338 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.94 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.82 
 
 
338 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.98 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  42.86 
 
 
353 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  37.1 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
354 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.88 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  39.34 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  31.13 
 
 
332 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.57 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  28.57 
 
 
226 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  33.33 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
564 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  39.34 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.34 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  25.22 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  25.22 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  34 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.04 
 
 
351 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  34 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.07 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  35.71 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.43 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.67 
 
 
353 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.78 
 
 
354 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.31 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  40.32 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.85 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  37.7 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.11 
 
 
336 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
586 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.31 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.31 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.7 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  31.96 
 
 
647 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.78 
 
 
354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.31 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.78 
 
 
354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.85 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  27.38 
 
 
226 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33 
 
 
101 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 
340 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  32.97 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.87 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.85 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  32.14 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.48 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.73 
 
 
353 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.38 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  30.48 
 
 
683 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
354 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.76 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.821654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>