21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2282 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2282  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  44.08 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  42.53 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3143  hypothetical protein  41.25 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60988  normal  0.0276228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  37.4 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  40.29 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3892  hypothetical protein  40.36 
 
 		 415 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.361535  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.98 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  23.71 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.23 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.3 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  22.3 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  21.97 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  22.11 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  24.08 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  22.73 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.51 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  24.68 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  20.79 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  21.29 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  21.88 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>