38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0747 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  37.58 
 
 
279 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  38.19 
 
 
495 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  38.46 
 
 
343 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  35.17 
 
 
971 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  29.51 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  29.51 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  31.06 
 
 
281 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  29.55 
 
 
874 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  28.92 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  25.9 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  24.81 
 
 
514 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  27.97 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  26.83 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  26.72 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  28.86 
 
 
536 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07912  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  28.86 
 
 
536 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00231  conserved hypothetical protein: N-acetyl-6-hydroxytryptophan oxidase (Eurofung)  26.13 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  34.43 
 
 
503 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05311  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  25 
 
 
383 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00354279  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  24.71 
 
 
534 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  27.27 
 
 
493 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01318  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
378 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  44.19 
 
 
850 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  37.5 
 
 
566 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  40.85 
 
 
535 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  40 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  40 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  24.52 
 
 
548 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  40 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  41.18 
 
 
506 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  23.46 
 
 
546 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.53 
 
 
690 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  24.77 
 
 
904 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  25.33 
 
 
599 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>