35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0337 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  100 
 
 
496 aa  1022    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  37.08 
 
 
515 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  37.24 
 
 
514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  29.17 
 
 
506 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  33.65 
 
 
503 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  24.53 
 
 
536 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  24.53 
 
 
536 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  25.57 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  29.41 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  29.6 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  28.92 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  29.41 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  29.41 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  28.67 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  26.36 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  26.07 
 
 
546 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  46.15 
 
 
566 aa  64.7  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  27.73 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00231  conserved hypothetical protein: N-acetyl-6-hydroxytryptophan oxidase (Eurofung)  26.61 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  25.77 
 
 
971 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  25.99 
 
 
279 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  25.5 
 
 
343 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 
340 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  25.53 
 
 
874 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  25.2 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  26.06 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  30.53 
 
 
542 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  24.31 
 
 
904 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  30.11 
 
 
535 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  30.11 
 
 
535 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  23.32 
 
 
599 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05311  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  36.76 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00354279  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07912  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  30.11 
 
 
535 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>