30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2427 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  100 
 
 		 506 aa  1033    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  37.38 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  35.84 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  29.33 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  30.41 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  33.73 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  24.95 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  32.35 
 
 		 503 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  31.28 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  32.61 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  32.61 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.27 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1838  hypothetical protein  31.19 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.327344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  44.07 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  25 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  25.38 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  25.24 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  42.37 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  42.37 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  42.37 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  23.59 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  47.17 
 
 		 850 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  32.37 
 
 		 666 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  45.76 
 
 		 542 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  35 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  26.61 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  26.61 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  25 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  37.1 
 
 		 904 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  33.7 
 
 		 971 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>