33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6129 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  99.44 
 
 		 536 aa  1099    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  100 
 
 		 536 aa  1106    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  37.55 
 
 		 566 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  29.15 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  27.9 
 
 		 515 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  31.03 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  24.53 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  22.3 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  35.71 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  24.77 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  28.69 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.8 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  26.49 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  24.32 
 
 		 535 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  24.32 
 
 		 535 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  22.83 
 
 		 850 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  35.26 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  23.72 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  24.89 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00231  conserved hypothetical protein: N-acetyl-6-hydroxytryptophan oxidase (Eurofung)  26.35 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  24.8 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  28.86 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  55.77 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  23.17 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  47.17 
 
 		 279 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  47.06 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  31.36 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  43.28 
 
 		 247 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  43.28 
 
 		 247 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  50 
 
 		 971 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  42.62 
 
 		 874 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  41.18 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  46 
 
 		 345 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>