34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5336 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  100 
 
 
548 aa  1112    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  27.84 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  29.31 
 
 
534 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  26.6 
 
 
514 aa  94  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  28.86 
 
 
515 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  28.16 
 
 
503 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  25.57 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  24.95 
 
 
506 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  25 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  25.43 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  23.75 
 
 
566 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  28.69 
 
 
343 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  25.45 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  26.92 
 
 
412 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  30.53 
 
 
281 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  29.21 
 
 
874 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  26.26 
 
 
971 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 
340 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  50 
 
 
850 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  32.04 
 
 
535 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  32.04 
 
 
535 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  32.04 
 
 
535 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  38.1 
 
 
535 aa  50.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  24.08 
 
 
416 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  30.25 
 
 
542 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  30.93 
 
 
345 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  24.89 
 
 
247 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  24.89 
 
 
247 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  24.52 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  23.45 
 
 
599 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07060  tyrosinase (AFU_orthologue; AFUA_1G17430)  32.47 
 
 
674 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.044074  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  40.38 
 
 
904 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07912  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 
369 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 
369 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>