31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1501 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  100 
 
 
412 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  45.48 
 
 
416 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  32.85 
 
 
495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  30.47 
 
 
279 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  30.04 
 
 
281 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  31.28 
 
 
874 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  28.5 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  28.5 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  26.83 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  27.78 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  29.63 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  31.07 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  28.89 
 
 
971 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  26.92 
 
 
548 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  28.64 
 
 
534 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  30.91 
 
 
503 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  25.2 
 
 
496 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.08 
 
 
690 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  34.07 
 
 
666 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  28.41 
 
 
514 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  27.84 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  30.59 
 
 
546 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  25.73 
 
 
506 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 
340 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  32 
 
 
535 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  41.18 
 
 
536 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  41.18 
 
 
536 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  32 
 
 
535 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  60 
 
 
850 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  32 
 
 
535 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  32 
 
 
535 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>