21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0316 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 		 690 aa  1440    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  35.94 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  29.41 
 
 		 535 aa  90.1  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  30.26 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  27.3 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  27.3 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  25.72 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  22.8 
 
 		 536 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  22.8 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  25.7 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  38.27 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  45.33 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  56.76 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  37.08 
 
 		 412 aa  55.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  38.89 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  37.14 
 
 		 850 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  35.71 
 
 		 493 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  28.71 
 
 		 345 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  34.88 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  34.88 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  32.97 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>